种子认证是提升种子质量、保障种源安全、推动种业高质量发展的重要制度。本文系统梳理了2023年至2025年新疆维吾尔自治区（以下简称“新疆”）农作物种子认证工作的开展情况。通过加强宣传培训、建设检查员队伍、发挥龙头企业示范作用等措施，新疆种子认证工作取得显著成效，申请企业数量和认证面积持续增长。同时，文章也分析了当前工作中存在的问题，如棉花等特色作物尚未纳入认证范围、企业认知度有待提高、认证优势体现不明显、专业人才匮乏等。最后，提出了加大宣传引导、强化队伍建设、利用制种大县政策红利等下一步工作建议，旨在为新疆乃至全国推进种子认证工作提供参考。