大豆品种鉴别及杂交F1代真杂种快速鉴定技术,是保障品种权保护、规范种业市场及提升杂交育种效率的关键支撑。本研究基于大豆真实性鉴定标准推荐的38个SSR标记,对40个不同生态区来源的大豆审定品种进行遗传多样性分析,筛选获得10个多态性标记组合。以现行国家大豆品种审定标准中“成对品种差异位点≥4个”为鉴别指标,该标记组合可实现40个供试大豆品种的两两精准区分。利用这10个标记检测2份小粒大豆品系与7份审定品种的遗传差异,发现小粒品系与品种间的多态性标记7-10个；进一步对二者正反交构建的137个F1单株进行真实性鉴定,共检测到124株真杂种。研究表明,筛选获得的10个SSR标记组合兼具品种鉴别与杂交种真实性鉴定的双重功能,结合荧光毛细管电泳技术可显著提升检测效率、降低检测成本,为大豆品种管理及杂交育种实践提供了高效、规范的技术支撑。