植物新品种作为农业发展中的重要领域，是农业知识产权和现代种业发展的核心内容。本文在一带一路农业合作背景下，通过农业国际合作新趋势的发展对我国种业面临的挑战进行了分析，探讨在种业发展中占据主要地位的植物新品种出现的保护制度亟需健全、相关法律法规之间衔接性欠佳、商业修饰性育种行为限制不力、行政管理部门职权划分僵硬、植物遗传资源惠益共享分配失衡等问题，对此笔者提出需以专门立法完善新品种保护制度，以制度创新引领育种体制创新，构建“二合一”综合行政管理体制，平衡育种者和遗传资源提供者的利益，助推农业知识产权的进步。