本研究利用组织研磨仪快速处理水稻种子样品，采用高通量的磁珠纯化系统提取样本DNA，提取的核酸通过紫外吸收检测其纯度，应用普通PCR检测方法和实时荧光PCR方法对水稻内源基因SPS、靶基因ATAF1进行检测。实验结果表明,普通PCR方法和实时荧光PCR方法均表现快速、准确、特异性高的特点。通过本研究初步建立检测转抗旱基因ATAF1水稻种子的普通PCR和实时荧光PCR方法。