本文通过对国家种业体制改革相关文件和文献的梳理，结合科研单位所属种业公司体制改革中的实际工作经验，分析了科研单位所属种业公司的基本特征和现状及所属种业公司面临的困境。提出了唯有建立起以公司为主体的商业育种创新体系，采用市场导向机制和商业育种机制，让种质资源顺畅的流向公司，使科技真正在公司里发挥作用。贯彻这一改制的路径，有助于科研单位所属种业公司改制的成功。